thermo賽默飛NanoDrop Ultra FL紫外分光光度計低濃度樣品測量不準
NanoDrop Ultra FL在處理低濃度樣品時出現偏差,核心原因是紫外吸收法的物理限制導致的信噪比不足。當DNA濃度低于2ng/μL時,測得的信號已經非常弱,和儀器本身的背景噪音幾乎相當,任何微小的干擾都會被放大,導致結果不可靠。
一、具體數值可以參考下表:
1、dsDNA
測量模式:吸光度模式
檢測限 (LOD):1 ng/μL
推薦用于精確定量(定量限):> 5 ng/μL
建議行動:如果濃度 >5 ng/μL,可使用。若在1-5 ng/μL之間,結果僅供參考,變異度較大。
2、RNA
測量模式:吸光度模式
檢測限 (LOD):約2 ng/μL
推薦用于精確定量(定量限):> 10 ng/μL
建議行動:同上,建議濃度在檢測上限范圍內測量
3、dsDNA
測量模式:熒光模式
檢測限 (LOD):0.1 ng/μL
推薦用于精確定量(定量限):0.1 - 100 ng/μL
建議與行動:低濃度樣品的選擇。覆蓋了吸光模式力所不及的范圍,推薦使用此模式。
4、RNA
測量模式:熒光模式
檢測限 (LOD):0.2 ng/μL
推薦用于精確定量(定量限):<10 ng/μL
建議與行動:對超低濃度RNA樣品進行高靈敏度檢測
二、除了原理的限制,操作不當也是造成結果不準的重要原因:
1、樣品問題:測量前充分混勻,特別是粘稠的基因組DNA,輕微的渦旋震蕩并短暫離心(如12,000rpm,2分鐘)即可。檢查樣品有無雜質或氣泡,如有,可離心或過濾處理。
2、操作細節:確保點樣量為1.5-2μL,能夠形成完整的液柱。測量時,請確保樣品覆蓋下基座檢測點,并立即放下檢測臂,防止樣品蒸發。
3、溶劑匹配:空白對照必須和樣品溶解液一致。例如,樣品用TE Buffer溶解,空白也需用相同的TE Buffer。
4、儀器狀態:保持上下基座光潔,并定期使用PV-1試劑盒執行性能驗證。同時,確保儀器環境穩定,無強光、無振動。
三、總結與核心建議
1、對于要求精準定量的低濃度樣品(如<2 ng/μL),最佳實踐是使用NanoDrop Ultra FL的熒光模式,其0.1 ng/μL的靈敏度遠超吸光度模式。
2、降低背景噪音:使用與樣品一致的空白緩沖液進行校正,減少背景干擾。
3、從源頭提升信噪比:如果樣品本身是從低豐度樣本中提取的,建議優化提取或純化流程,從源頭上提升樣品濃度。
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